En 1996 , elle bénéficia de la création d'un Secrétariat d'Etat près du Ministère des Forces Armées chargé de la Gendarmerie Nationale . Et ce, en raison d'un besoin ressenti d'autonomie (budgétaire et de gestion) et de nécessité de représentation dans les instances décisionnelles, pour une meilleure efficacité d'action.

Les Secrétaires d'Etat à la Gendarmerie successifs :

- 1996-1997 : Le Général de Brigade ANDRIAMANANTSOA Guy

- 1997- …… : Le Général de Division BORY Jean Paul

B) - ORGANISATION

Arme de personnel composé d'officiers (généraux, supérieurs et subalternes), gendarmes principaux, gendarmes et de personnel civil ; la gendarmerie excipe d'un organigramme bien déterminé :

D R H : Direction des Ressources Humaines GSIS : Groupes de Sécurité et d'Intervention Spéciales

D T : Direction Technique CFUM : Centre de Formation des Unités Mobiles

D O E : Direction de l'Organisation et de l'Emploi CSI : Compagnie de Sécurité Intérieure

D A F : Direction Administrative et Financière DSI : Détachement de Sécurité Intérieure

D S R : Direction de la Sécurité et des Renseignements CFS : Commandement des Formations Spécialisées

CIRGN : Circonscriptions de la Gendarmerie Nationale EGNA : Ecole de la Gendarmerie Nationale à Ambositra

FIGN : Forces d'Intervention de la Gendarmerie PMP : Peloton Mobile Porté

ESGN : Ecole Supérieure de la Gendarmerie Nationale

CRFDC : Centre de Reproduction et de Formation de Dressage Canin